Bisogna riuscire a coordinare i diversi interventi di conservazione affinché la tutela di queste aree rientri nelle strategie e quindi nelle politiche concrete di conservazione nazionali e regionali per questo il WWF organizza ogni anno un convegno nazionale dedicato alla conservazione ecoregionale.

Nel 2006 in occasione delle celebrazioni per i 40 anni del WWF Italia, l'Associazione ha firmato un protocollo d'intesa con Il Ministero dell'Ambiente che è diventato partner della conservazione ecoregionale per l'Ecoregione Mediterraneo Centrale.

Nel 2005 l'incontro del 9 e 10 giugno dal titolo "Conservazione Ecoregionale, Reti Ecologiche e Governo del Territorio" ha offerto l'occasione per un confronto in grado di fornire strumenti operativi in risposta a quanto previsto dall'attuazione del Codice dei beni culturali e del paesaggio (Codice Urbani, d.lgs 22.1.2004 n. 42). La normativa impone, infatti, la redazione da parte delle Regioni del nuovo piano paesaggistico mirato a uno sviluppo sostenibile del territorio.

Il convegno del 2004 "Ecoregioni e Reti Ecologiche: la pianificazione e la conservazione" ha visto nascere le prime linee guida per una gestione sostenibile del territorio.