Le minacce principali sulle quali si concentra l'impegno del WWF sono quattro: il taglio illegale per il commercio di legname, la conversione del territorio forestale in aree di pascolo o per l'agricoltura, i cambiamenti climatici e gli incendi. Per i prossimi anni, il WWF si è prefissato tre obiettivi per la difesa delle foreste: l’aumento della superficie di foreste protette (almeno altri 75 milioni di ettari di foreste protette entro il 2010), il restauro e la certificazione.

Per centrare questi obiettivi il WWF segue come linee guida: la tutela attraverso aree protette (solo l'1 per cento delle foreste del mondo è oggi protetto) le certificazione (cioè lo sfruttamento sostenibile, attraverso il marchio FSC che ne garantisce gli standard), e il restauro forestale, per riportare foreste degradate in condizioni di naturalità. Conservare in salute la stragrande maggioranza degli ecosistemi forestali vuol dire salvare una biodiversità straordinaria e garantire la vita delle comunità locali. Un’economia equilibrata può essere creata mantenendo un sistema forestale pienamente funzionale.

La certificazione forestale secondo i principi del Forest Stewardship Council (FSC) è la garanzia che il legno o la carta di cui sono fatti i prodotti in commercio non sono costati la distruzione di una foresta o l’espropriazione della terra di popolazioni indigene. Già oggi oltre 30 milioni di ettari di foreste in 56 paesi ed oltre 2.2 mila aziende nel mondo sono certificati FSC. Con la campagna Forest for Life, in sei anni il WWF ha posto sotto tutela 110 milioni di ettari di foresta.

Il WWF, in Brasile, ha già dato prova tangibile del suo impegno: ha creato l'ARPA (Amazon Region Protected Area), un programma che ha determinato la protezione di oltre 50 milioni di ettari, più grande dell’intero sistema di parchi degli USA o equivalente alla superficie della Spagna. E ha contribuito alla certificazione forestale di oltre 500 mila ettari di foresta statale, la cui gestione è ora accreditata con il marchio di qualità FSC (Forest Stewardship Council). Il WWF è attivo in Amazzonia da 40 anni. Le attività del WWF Brasile mirano a sostenere lo sviluppo delle politiche nazionali sulle aree protette in Amazzonia, legandole ad un uso sostenibile delle risorse e soprattutto a far sì che le risorse naturali possano essere gestite dalle popolazioni locali, in particolare dalle popolazioni indigene.

In Italia il WWF, grazie alle varie edizioni dell'Operazione Beniamino, ha assicurato un futuro a circa 10 mila ettari di bosco, protetti da incuria, incendi, taglio selvaggio. Grazie alle Oasi protegge importantissime aree di boschi preziosi come la foresta mediterranea di Monte Lattias in Sardegna, bosco Rocconi in Toscana, il lariceto secolare di Val Trigona in Trentino.

Nel 2001 il WWF ha lanciato il Italia il Club per il legno Ecocertificato,una iniziativa di promozione e sostegno alla certificazione forestale secondo i principi del Forest Stewardship Council (FSC) . Oggi in Italia sono 53 le aziende che hanno ottenuto la certificazione forestale FSC, mentre in Sardegna è nata la prima sughereta al mondo a produrre sughero secondo metodi certificati da FSC, grazie alla collaborazione tra la Stazione Sperimentale del Sughero di Tempio Pausania, il Gruppo Sughero di Assolegno/Federlegno-Arredo e il WWF Italia.